遠距健康照護互通資源標準(FHIR)學習資源

全球已邁入大量人口老年化趨勢，長期健康照顧及銀髮照顧已成為國內外未來共同目標，如何將病人由各種穿戴式器具收集到的健康資料透過大量搜集並且回饋運用，讓不同機構、系統平台與裝置以數據元串連，即為當今開發者需學習FHIR重要課題。HL7協會致力於電子健康資訊標準訂定，至今有五十多個國家1600多名會員，其中包括500多個團體會員代表：醫院、政府單位、醫療保險業者、國際藥廠、生技資訊產業等單位，共同發展健康資訊的交換、整合、分享、和取用。FHIR墊基於HL7-v2和v3資料標準，用更簡便標準，將醫療訊息廣泛使用串聯包括電腦、平板電腦、智慧手機、穿戴裝置及各種支援藍芽生理監測裝置和運動紀錄器。

2019年11月28日星期四

JavaScript基本知識-Event事件

JavaScript的事件處理器

事件處理程序可用於處理和驗證用戶輸入，用戶操作和瀏覽器操作：

每次頁面加載時應該做的事情
關閉頁面時應該做的事情
用戶單擊按鈕時應執行的操作
用戶輸入數據時應驗證的內容
和更多 ...

可以使用許多不同的方法來使JavaScript處理事件：

HTML事件屬性可以直接執行JavaScript代碼
HTML事件屬性可以調用JavaScript函數
您可以將自己的事件處理函數分配給HTML元素
您可以防止事件被發送或處理
和更多 ...

常見的HTML事件列表:

Event	Description
onchange	An HTML element has been changed
onclick	The user clicks an HTML element
onmouseover	The user moves the mouse over an HTML element
onmouseout	The user moves the mouse away from an HTML element
onkeydown	The user pushes a keyboard key
onload	The browser has finished loading the page

單引號：Single quotes

<element event='some JavaScript'>

雙引號：Double quotes

<element event="some JavaScript">

2019年11月23日星期六

Java StAX學習與建構2/2

IntelliJ 開發環境建置

IntelliJ IDEA是一種商業化銷售的Java 整合式開發環境（Integrated Development Environment，IDE）工具軟體，由JetBrains軟體公司（前稱為IntelliJ）開發，提供Apache 2.0開放式授權的社區版本以及專有軟體的商業版本，開發者可選擇其所需來下載使用(維基百科)。

版主考慮使用此IDE開發工具，主要原因是為建立與建設RestfulServer模組，此模組可用於任意數據源創建FHIR服務器端點，而數據源也可以是自己設計的Database或現有臨床系統，RestfulServer也可以在不依賴任何外部Database的情況下運行，但是也可以配置為使用Oracle，Postgres等安裝。此篇我們須先完成所需要的建置環境後，再接續完成最重要的RestfulServer安裝與連線測試。

IDEA下載路徑與安裝指令

首先進入到IntelliJ IDEA官網，選則Linux的ultimate下載。
下載完成後解壓縮到opt目录：sudo tar -zxvf ideaIU-2018.2.2cd.tar.gz -C /opt
切換到idea的bin目錄：cd /opt /idea-IU-182.4129.33/bin
運行idea.sh：./idea.sh

2019年11月19日星期二

JavaScript基本知識-2

JavaScript的物件種類

JavaScript物件種類可分為三大類；

內建物件，物件除了有屬性與方法之外，有些還具有父繼承子的關係。
BOM(Browser Object Model)的物件，是將瀏覽器的元素物件化，根據BOM規格化控制瀏覽器各元件的動作。
DOM(Document Object Model)的物件，將HTML及XML標記的文件當作JavaScript物件來處理。

物件示意Object	Properties	Methods
	car.name = Fiat car.model = 500 car.weight = 850kg car.color = white	car.start() car.drive() car.brake() car.stop()

物件意義如同圖所示
所有汽車都具有相同的屬性，但是每個汽車的屬性值都不同。
所有汽車都有相同的方法，但是方法是在不同的時間進行的。

物件也可以具有方法。
方法是可以對對象執行的動作。
方法存儲在屬性中作為函數定義。

內建物件；

指的就是日期、時間、字串及函式等包含在JavaScript規格中的基本物件。

BOM物件；

要存取下層物件時，需使用點運算子「.」，例如顯示網頁部分寫成「window.document」，指定BOM物件時，可以省略最上層的Window物件。

DOM物件

此物件擔任連結JavaScript與HTML角色。DOM是以document為頂點的樹狀結構所構成，構成樹狀結構的元素(element)及屬性(attribute)，我們稱之為節點(node)，在JavaScript中利用document的方法來取得節點的集合，並對其進行操作。各節點透過3個方法進行存取；

以ID屬性名稱存取:document.getElementById(id 屬性名稱);
以NAME屬性名稱存取:document.getElementByName(name 屬性名稱);
以HTML的元素名稱存取:document.getElementByTagNmae(元素名稱);

name屬性及HTML的元素名稱，在HTML中會有多個存在。故從getElementByName()方法與getElementByTagName()方法名稱當中的複數形「Elements」即可瞭解，這兩個方法會傳回多個物件，因此用存取陣列的方式「0」開始的索引編號進行存取。要注意的是，「–」刪節號的屬性無法直接在JavaScript中進行處理，故將刪節號之後的字母改為大寫，並將「–」刪節號移除進行設定。

This關鍵字

在函數定義中，`this`指的是函數的“owner”。

在下面的示例中，`this`是 `person 物件`“owner”`fullName`的功能。

換句話說，`this.firstName`表示此對象的屬性firstName。

2019年11月18日星期一

JavaScript基本知識-1

JavaScript學習

JavaScript(通常縮寫為JS）是一種進階的、直譯的程式語言是用來網頁上做出動態內容的腳本語言，也是前端工程師需要學會的程式語言之一，JavaScript是一門基於原型、函式先行的語言，是一門多範式的語言，它支援物件導向編程，指令式程式設計，隨著最新的HTML5和CSS3語言標準的推行它還可用於遊戲、桌面和行動應用程式的開發和在伺服器端網路環境執行，如Node.js。如果單靠HTML和CSS是無法產生動態網頁的，在後續學習中將會學習如何使用JavaScript來DOM(Document Object Model)動態存取HTML及XML籤內容延伸到針對FHIR標籤內容來編輯元素、屬性和節點。有關此章節說明與應用可參考國外W3C School網站學習與模擬測試。

JavaScript是Web開發人員必須學會的三種語言之一

HTML定義網頁內容

CSS指定網頁的佈局

使用JavaScript編寫網頁行為

JavaScript在網頁中崁入有三種方法

寫在<script>標籤之間

寫在HTML標籤之間

寫在外部的JavaScript檔案中

<script>標籤之間範例；

<script type ="text/javascript">

//<![CDATA

window.alert("Hello!");

//]]>

</script>

利用HTML標籤之事件處理器的範例

<input type="button" value="請按一下" onclick="alert('按鈕啟動');"/>

寫在外部JavaScript檔案中，提醒使用外部檔案中文等英數文字、符號以外的字元時，文字編碼要與HTML檔案相符，若不同可以藉由charsetcharset屬性來設定。

JavaScript的撰寫規則

可以在多個不同瀏覽器使用但必須確認效果都相同

在HTML中的位置可須分三處

<head>標籤之間程式會用到事件的處理動作

<body>標籤之間程式在讀入<body>標籤內元素後執行處理動作

HTML標籤的事件處理器

標識符是名稱。在JavaScript中，標識符用於命名變量（以及關鍵字，函數和標籤）。在大多數編程語言中，法定名稱的規則幾乎相同。在JavaScript中，第一個字符必須是字母，下劃線（_）或美元符號（$）。後續字符可以是字母，數字，下劃線或美元符號。

JavaScript區分大小寫

在每個可執行語句的末尾添加分號；請務必養成習慣。

JavaScript會忽略多個空格

JavaScript語句可以在大括號{...}中的代碼塊中分組在一起。

JavaScript關鍵字如下圖所示

Keyword Description

break Terminates a switch or a loop

continue Jumps out of a loop and starts at the top

debugger Stops the execution of JavaScript, and calls (if available) the debugging function

do ... while Executes a block of statements, and repeats the block, while a condition is true

for Marks a block of statements to be executed, as long as a condition is true

function Declares a function

if ... else Marks a block of statements to be executed, depending on a condition

return Exits a function

switch Marks a block of statements to be executed, depending on different cases

try ... catch Implements error handling to a block of statements

var Declares a variable

JavaScript禁止使用的規則

使用半形英數文字及「ˍ」(底線)、「＄」(錢號)

名稱的第1個字為數字

JavaScript的保留字

JavaScript保留字

break

case

catch

continue

default

delete

do

else

finally

for

function

if

in

instanceof

new

return

typeof

this

throw

try

with

未來預定保留字

abstract

boolean

byte

char

class

const

debugger

double

enum

export

extends

final

float

goto

implement

import

int

interface

long

native

package

private

protected

public

short

static

super

synchronized

throws

transient

volatile

Keyword	Description
break	Terminates a switch or a loop
continue	Jumps out of a loop and starts at the top
debugger	Stops the execution of JavaScript, and calls (if available) the debugging function
do ... while	Executes a block of statements, and repeats the block, while a condition is true
for	Marks a block of statements to be executed, as long as a condition is true
function	Declares a function
if ... else	Marks a block of statements to be executed, depending on a condition
return	Exits a function
switch	Marks a block of statements to be executed, depending on different cases
try ... catch	Implements error handling to a block of statements
var	Declares a variable

2019年11月10日星期日

Java StAX學習與建構1/2

StAX使用說明

StAX規範定義了API的許多例子：

資料綁定

解組XML文檔

編組XML文檔

並行文件處理

無線通信

簡單對象訪問協議（SOAP）消息處理

解析簡單的可預測結構

解析具有前向引用的圖形表示

解析Web服務描述語言（WSDL）

虛擬數據源

查看存儲在數據庫中的XML數據

查看通過XML數據綁定創建的Java對像中的數據

將DOM樹作為事件流進行導航

解析特定的XML詞彙表

流水線XML處理

StAX與其他JAXP API進行比較：

StAX不如TrAX或JDOM強大或靈活，但也不需要那麼多的內存或處理器負載就可以使用，並且StAX在許多情況下都可以勝過基於DOM的API。在StAX和SAX之間進行最接近的比較，正是在這裡StAX提供了許多情況下都有益的功能。其中一些包括：

啟用StAX的客戶端通常比SAX客戶端更易於編碼。儘管可以說SAX解析器在編寫上稍微容易一些，但StAX解析器代碼可以更小，並且客戶端與解析器進行交互所必需的代碼也更簡單。
StAX是雙向API，這意味著它可以讀取和寫入XML文檔。SAX是只讀的，因此如果要編寫XML文檔，則需要另一個API。
SAX是推式API，而StAX是拉式。上面概述的推式和拉式API之間的權衡在這裡適用。

Feature	StAX	SAX	DOM	TrAX
API Type	Pull, streaming	Push, streaming	In memory tree	XSLT Rule
Ease of Use	High	Medium	High	Medium
XPath Capability	No	No	Yes	Yes
CPU and Memory Efficiency	Good	Good	Varies	Varies
Forward Only	Yes	Yes	No	No
Read XML	Yes	Yes	Yes	Yes
Write XML	Yes	No	Yes	Yes
Create, Read, Update, Delete	No	No	Yes	No

環境設置

為了使用StAX的解析器，應該準備好stax.jar在應用程序的類路徑中。官方網站範例說明，下載 stax-1.2.0.jar.

以下是StAX API的功能

讀取XML文件從上到下，認識構成一個結構完整的XML文檔的標記
令牌是以相同的順序進行處理，它們出現在文檔中
報告應用程序，因為解析器遇到標記的特性
應用程序提供了一個“事件”讀取器充當了事件，以獲得所需信息的迭代器和迭代。可另一個讀取器是“光標”充當一個指向XML節點。
由於事件被識彆，XML元素可以從事件對象進行檢索，並且可以進一步處理。

XMLEventReader類

因為在解析XML文檔時該類提供可用於迭代事件事件迭代器

StartElement asStartElement() - 用於檢索值和元素的屬性。
EndElement asEndElement() - 調用元件的端部。
Characters asCharacters() - 可用於獲得字符，例如一個CDATA，空白等。

XMLEventWriter類

此接口指定創建事件的方法。

add(Event event) - 添加包含元素XML事件。

XMLStreamReader Class

因為在解析XML文檔時該類提供可用於迭代事件事件迭代器

int next() - 用於檢索下一個事件。
boolean hasNext() - 用於檢查其他事件的存在與否
String getText() - 用於獲取一個元素的文本
String getLocalName() - 用於獲取一個元素的名稱

XMLStreamWriter類

此接口指定創建事件的方法

writeStartElement(String localName) - 加入定名稱開始元素。
writeEndElement(String localName) - 添加指定名稱的結束元素。
writeAttribute(String localName, String value) - 編寫屬性到元素

StAX Factory Classes

XMLInputFactory，XMLOutputFactory和XMLEventFactory，使您可以定義和配置XML流讀取器，流寫入器和事件類的實現實例。

Use the javax.xml.stream.XMLInputFactory system property.

Use the lib/xml.stream.properties file in the Java SE platform's Java Runtime Environment (JRE) directory.

Use the Services API, if available, to determine the classname by looking in the META-INF/services/javax.xml.stream.XMLInputFactory files in JAR files available to the JRE.

Use the platform default XMLInputFactory instance.

Deriving from JAXP, the XMLInputFactory.newInstance method determines the specific XMLInputFactory implementation class to load by using the following lookup procedure:

After getting a reference to an appropriate XMLInputFactory, an application can use the factory to configure and create stream instances. The following table lists the properties supported by XMLInputFactory. See the StAX specification for a more detailed listing.

`javax.xml.stream.XMLInputFactory` Properties
Property	Description
`isValidating`	Turns on implementation-specific validation.
`isCoalescing`	(Required) Requires the processor to coalesce adjacent character data.
`isNamespaceAware`	Turns off namespace support. All implementations must support namespaces. Support for non-namespace-aware documents is optional.
`isReplacingEntityReferences`	(Required) Requires the processor to replace internal entity references with their replacement value and report them as characters or the set of events that describe the entity.
`isSupportingExternalEntities`	(Required) Requires the processor to resolve external parsed entities.
`reporter`	(Required) Sets and gets the implementation of the `XMLReporter` interface.
`resolver`	(Required) Sets and gets the implementation of the `XMLResolver` interface.
`allocator`	(Required) Sets and gets the implementation of the `XMLEventAllocator` interface.

2019年11月9日星期六

Fhirbase公測伺服-測試篇2/2

業務規則查詢

現在，當我們知道如何使用基本的JSONB運算符時，讓我們編寫範例查詢以獲取一些有用的數據。假設我們正在開發一個EHR系統，該系統需要在某些屏幕上顯示高危患者列表。高風險標準如下：

男
年齡> 45歲
前吸煙者或活躍吸煙者

範例寫了一個查詢吸煙者的觀察結果。對其進行修改，使其包括過去的吸煙者：實施第三個條件後，讓我們將此查詢與一個患者表結合起來以實現第一個和第二個條件：

SELECT DISTINCT(p.id), p.resource#>'{name,0}'
FROM patient p
JOIN observation o ON o.resource#>>'{subject,id}' = p.id
WHERE (o.resource @> '{"code": {"coding": [{"code": "72166-2"}]}}'::jsonb)
-- LOINC: Smoking status
AND ((o.resource @> '{"value": {"CodeableConcept": { "coding": [{"code": "449868002"}]}}}')
-- SNOMED: Current every day smoker
OR (o.resource @> '{"value": {"CodeableConcept": { "coding": [{"code": "8517006"}]}}}'))
-- SNOMED: Former smoker
AND (extract(year from age(now(), (p.resource->>'birthDate')::date)) > 45) -- patient's age > 45
AND (p.resource->>'gender' = 'male'); -- patient gender is male
在此對語法解釋一下如何取出年齡部分，(p.resource->>'birthDate')為其強制轉換為PostgreSQL的DATE類型。::datePatient.birthDate，並將DATE類型接受FHIR格式的日期。函式age(DATE, DATE)返回一個INTERVAL值，該值表示兩個時間戳之間的時間距離，取回患者的年齡。age(NOW(), (p.resource->>'birthDate')::date)>45
令人驚訝的是，我們剛剛發現60名高危患者。並不難，對吧？